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基于结构的药物设计

靶蛋白的三维结构,特别是结合配体的三维结构,是指导药物发现的重要信息来源。亚搏手机版app下载大量基于结构的药物设计工具,由基于配体的方法,可用于新化合物的设计和优化。

  • Sygnature与...密切合作峰值蛋白质使我们能够代表客户生成蛋白质结构,获取缺乏结构信息的目标的x射线晶体学数据,并阐明代表性的结合模式,从而驱动基于结构的优化。
  • 对于那些缺乏结构数据且难以结晶的靶点,我们在基于相关蛋白生成同源模型方面有丰富的经验。
  • 我们的专家计算团队分析所有可用的结构信息,并与计算机共享结果和3D可视化工具药物化学团队鼓励创意产生和改善复合设计。
  • 柔性配体对接和4D对接,以考虑蛋白质灵活性,应用于优先级的设计思想和3D完全交互式配体编辑器,可用于绑定站点中的配体优化。
  • 一系列现代技术被用于评估和排序结合位姿的亲和力和稳定性,包括短轨迹MD模拟、MM/PBSA和网格自由能计算。
  • 我们可以应用水评价技术来确定溶剂热力学在结合位点的有利和不利区域。基于对水结构的理解,在先导化合物中引入极性功能,通常有利于其物理性质、效能和特异性。

我们热衷于获取和使用尖端工具来推进药物发现,并一直在寻找方法来提高我们的能力。亚搏手机版app下载因此,我们已经开始与一位领先的学术专家合作自由能量扰动(FEP)计算。作为这种持续努力的一部分,我们正在研究影响蛋白质配体结合自由能估计的准确性的因素。在最近的研究中,我们强调了初始晶体结构对自由能预测结果的影响,并强调了在运行FEPs时罕见事件采样和长时间尺度动力学的重要性。我们目前正致力于寻找计算解决方案,以提高预测精度。

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